CT的工作程序涉及以下几个关键步骤：首先，根据人体不同组织对X线的吸收和透过率的不同，使用高灵敏度仪器对人体进行测量。测量所获取的数据随后被输入到电子计算机中进行处理，终生成人体被检查部位的断面或立体图像，从而能够发现体内检测部位的细小病变。
CT图像的重建通常采用多种数学算法，如直接反投影重建方法、滤波反投影算法（FBP）、直接傅立叶变换算法等。这些算法能够从投影数据中求解物体内部衰减系数的分布，从而无损地检测物体内部结构信息。图像重建是CT成像过程中的关键步骤，它直接影响到终图像的质量和诊断的准确性。
活体组织检查 从患者身体的病变部位取出小块组织（根据不同情况可采用钳取、切除或穿刺吸取等方法）或手术切除标本制成病理切片，观察细胞和组织的形态结构变化，以确定病变性质，作出病理诊断，称为活体组织检查（biopsy），简称活检。这是诊断肿瘤常用的而且较为准确的方法。近年来由于各种内窥镜（如纤维胃镜、纤维结肠镜、纤维支气管镜等）和影像诊断技术的不断改进，不但可以直接观察某些内肿瘤的外观形态，还可在其指引下准确地取材，进一步提高了早期诊断的阳性率。
造影超声心动图
在二维图像或M型超声监视下，由静脉注射声学造影剂。中国常用 3%过氧化氢或碳酸氢钠醋酸混合液，造影剂与血液混合后含有微小气泡（可吸收），在右侧心腔产生云雾状回声，根据显影的部位、扩散范围、光点密度、运行方向等，可确定心内有无右向左的分流及其分流水平（图10）。对左向右分流患者，右侧心腔可有负性造影区。对右心负荷过重者，可借助造影判定右室前壁有无增厚、右室是否扩大，亦可判断室间隔有无增厚。根据瓣口处造影剂有无来回穿梭现象，可以了解有无三尖瓣关闭不全。可测量静脉注射声学造影剂到心前区出现造影剂的时间，即臂心循环时间（正常人一般在10秒左右；心力衰竭者>15秒）。根据M型超声心动图上造影剂流线的倾斜度，可计算该区的血流速度。本法对主动脉瓣、二尖瓣关闭不全和左向右分流的诊断有一定的意义。一种超声造影心肌灌注显影增强检查法对冠心病的诊断有意义。