保函条款方面
格式不符：招标文件对保函格式有严格要求，但银行提供的格式与之不完全匹配，如索赔方式、期限等条款的表述不同，可能导致投标无效或引发其他问题。
条款不清：保函中的某些条款表述含糊，容易引发误解或争议，如保证方式、保证范围、索赔条件等约定不明确，可能在后期出现纠纷时，无法确定各方的权利和义务。
费用方面
费用过高：企业对银行收取的保函费用有疑问，觉得费用过高或者收费标准不透明，不同银行的收费标准差异较大，企业可能不清楚费用是如何计算的，增加了财务成本。
费用争议：在保函办理过程中，可能会出现一些额外费用，如加急费、修改费等，企业事先未了解清楚，导致与银行产生费用争议。
短期保函：期限在 3 个月以内的短期保函，收费相对较低，一般为保函金额的 0.5‰-1.5‰左右。如 3 个月期限、100 万元的投标保函，费用可能在 500 元 - 1500 元。
长期保函：期限在 1 年以上的长期保函，银行承担风险时间长，收费会较高，可能达到保函金额的 1%-3% 左右。比如 2 年期限、500 万元的履约保函，费用可能在 5 万元 - 15 万元。
合理安排申请时机与保函条款
把握银行冲量节点：银行在季度末、年末等时间节点可能有业务冲量需求，此时申请保函，银行可能为完成指标而给予一定费率优惠。
优化保函条款：在不影响项目需求和合作方要求的前提下，尽量缩短保函期限、降低保函金额。期限越短、金额越小，银行收费通常越低。同时，选择风险相对较低的保函类型，如能用投标保函解决问题，就不用履约保函。