排列
按时间顺序排列：对于同一类档案，按照其形成的时间先后顺序进行排列，能清晰地反映事物的发展过程。
按重要程度排列：将重要的档案排在前面，次要的排在后面，便于优先查阅重要档案。
按文号排列：按照文件的发文字号顺序排列，适用于有明确文号的档案，方便通过文号快速查找档案。
编号
档号编制：给每个档案或档案盒编制的档号，档号应包含分类号、年度、案卷号等信息，例如 “XZ - 2023 - 001”，其中 “XZ” 表示行政档案，“2023” 是年度，“001” 是案卷号。
编号标识：在档案盒或档案上清晰地标注档号，可使用标签或直接打印在档案盒上，确保编号醒目、易于识别。
全宗原则：全宗是一个独立的机关、组织或个人在社会活动中形成的全部档案的有机整体。档案整理要维护全宗的完整性，即同一全宗的档案不可分散，不同全宗的档案不得混淆。这有助于保持档案之间的内在联系，反映一个特定主体的活动全貌。比如，某企业的档案构成一个全宗，其各个部门、各个时期形成的档案都应归属于这个全宗，不能将该企业的档案与其他企业的档案混在一起整理。
按来源分类
组织机构分类法：按照档案形成的组织机构进行分类，将同一部门或单位形成的档案集中在一起。如政府机关中，不同科室形成的档案分别归类，能体现各部门的职能和工作范围，以及部门之间的协作关系。
作者分类法：以档案的作者为分类依据，将同一作者形成的档案归为一类。对于个人档案或一些特定作者群体的档案，这种分类方法有助于了解作者的思想、工作风格和学术成就等。