分类
按年度分类：将档案按其形成的年度分开，不同年度的档案分别整理。这种方法适用于大多数档案，能保持档案在时间上的连续性。
按机构分类：按照档案形成的机构或部门进行分类，便于查找和利用与特定机构相关的档案。
按问题分类：根据档案所反映的主题或问题进行分类，能集中反映某一特定问题的相关档案。
按保管期限分类：将档案按规定的保管期限进行分类，如、长期、短期，以便于档案的鉴定和销毁。
实际操作中，通常采用复式分类法，如年度 - 机构、年度 - 问题等组合方式。
档案整理是一项细致且重要的工作，以下是一些注意事项：
保持档案的原始状态：在整理过程中，应尽可能保持档案的原始形成状态和历史联系，不随意更改档案的内容和顺序，确保档案的真实性和完整性。
分类准确：依据预先制定的分类方案，按照档案的形成规律、内容特点和管理要求进行分类。分类时要严格遵循分类标准，避免出现分类错误或交叉混乱的情况，确保同一类别的档案具有共同的属性和特征。
编号规范：档号的编制要遵循一定的规则和标准，具有性和稳定性。编号应简洁明了，易于识别和记忆，同时要确保编号在档案管理系统中能够准确对应相应的档案实体，方便档案的检索和利用。
保护档案实体：在整理过程中，要注意保护档案的纸张、字迹、图像等不受损坏。避免档案受到潮湿、灰尘、虫害、火灾等自然因素的影响，同时要轻拿轻放，防止人为的撕裂、污损等情况发生。对于破损或老化的档案，应及时进行修复和保护处理。
尊重档案的机密性：对于涉及机密的档案，要严格遵守保密制度，采取相应的保密措施。在整理过程中，确保档案不被无关人员查阅或泄露，档案的保管和利用也要按照保密规定进行操作。
数据录入准确：将档案信息录入电子目录或档案管理系统时，要保证数据的准确性和完整性。仔细核对每一项信息，避免出现录入错误或遗漏，确保电子目录与档案实体信息一致，以便于地检索和管理档案。
做好标识和标注：在档案盒、文件夹及档案本身等位置，要清晰、准确地标注档号、题名、年度等关键信息。标注应使用规范的字体和颜色，确保字迹清晰、持久，便于快速查找和识别档案。
定期复查：档案整理完成后，应定期进行复查，检查档案的分类、编号、装订等是否符合要求，档案实体是否有损坏或丢失等情况。如发现问题，要及时进行调整和处理，以保证档案整理工作的质量和档案的管理。
遵循相关标准和规范：档案整理工作要遵循国家和行业相关的标准和规范，如《归档文件整理规则》《机关档案工作条例》等。这些标准和规范对档案整理的各个环节都做出了明确规定，是确保档案整理工作规范化、标准化的重要依据。
建立索引和目录：为了方便档案的查询和利用，应建立完善的索引和目录体系。索引和目录应详细、准确地反映档案的内容和排列顺序，能够帮助使用者快速定位所需档案。同时，要根据档案的新增、变动情况及时更新索引和目录。
来源原则：强调档案应按照其形成来源进行整理和分类。同一形成者或同一组织机构形成的档案应集中在一起，不同来源的档案应分开整理。这样可以保持档案在来源方面的独立性和完整性，便于从档案的形成背景和历史沿革角度进行管理和利用。例如，一个机关单位的档案要与其他机关单位的档案区分开来，单独进行整理和分类。
按内容主题分类
问题分类法：依据档案所反映的主题内容进行分类，将同一问题或同一专题的档案集中整理。例如，企业关于产品研发的档案，可将涉及不同产品研发的市场调研、技术方案、实验数据等归为一类，便于集中查阅和研究相关问题。
事由分类法：按照档案所涉及的具体事件或事务进行分类。如在处理法律纠纷时，将与该纠纷相关的合同、往来信件、庭审记录等档案整理在一起，能呈现事件的起因、经过和结果。