一、洁净室节能
1、合理计算和利用新风量节能确定合理的换气次数
大多数洁净室的换气次数都没有经过计算确定，一般都偏大，致使风口送风速度和室内风速太大，反而有扬尘的影响，而且送风能耗增加。洁净室需要大量新风的另一个重要原因是有局部排风，但局部排风并非全天运行，可以根据室内正压变化或者排风量变化，不断调节新风量，以维持既定的正压。工程实测表明，这样可以节电38%，节冷56%。还可以采用节能型排风柜，减少系统和空调器的漏风量。综合利用洁净气流，是洁净室特有的节能途径。在不影响洁净度要求的前提下，串联和交叉使用洁净气流可以节省30%～40%的能耗。
2、采用节能方式节约能量
采取臭氧方式在具有空调净化系统(HVAC系统)控制的洁净环境中可以节省不少能量。因为装置过滤网将产生风管系统的压损，因此选用过滤网时应采用低压损型产品，另外由于过滤网经久使用后会产生集尘效果，虽然捕捉效率仍佳，但相对也造成压损增加，因此定时更换过滤网也是降低压损的方式。在很多情况下，可以采用低阻过滤器或者低阻亚过滤器的，就不用阻力高出3~4倍的过滤器，可以减少送风动力能耗。
3、减少和利用排风
病检科、核医科和实验室等场所的排气可分为毒性气体(结核菌、EO、放射性)、酸性气体及有机溶剂等废气，在作业环境中这些气体可控制在抽气柜内，按照不同种类的排气予以区分，经过处理达到环保标准后才能排放至大气。排气量与新鲜空气补给量由于有质量平衡的关系，因此合理控制减少排气量，除了可降低排气风机运转电力外，而且可降低外气所引入的空调负荷。
4、自动控制
对洁净间而言，空调系统实现自动化监控，可以在满足系统运行及保证系统的各种技术指标的同时，限度地实现节能控制，符合日益突出的节能和环保需要。有关资料表明，采用空调自控系统后，可节约空调系统设备年度运行费用的10%，更乐观的估计认为可达15%~30%，而空调自控产品的投资占整个医院总投资的0.5%左右，收回投资时间很短。同时，由于实现设备的自动控制和管理水平，减少突发事故的发生和设备损坏，从而带来潜在效益。可以使系统更地运行，并限度地提高舒适程度。